3X01：這一集延續上一集的劇情，歐尼爾被寄生蟲附生之後，還好遇到一個高 達人是Tok'ra人（2X12Tok'ra人是高達人的一支分裂民族，他們願意跟人類共享身體，科技跟高達人差不多是地球人的友邦，卡特上尉的父親因為 得到癌症，願意當作Tok'ra人的宿主，成為地球人跟Tok'ra人的橋樑），他用冷凍方式將歐尼爾冷凍，將寄生蟲殺死。
另一方面，地球派出的SG聯軍，攻打入外星基地，但是回程時卻被高達人的力場防護罩給困在星際之門外面，於是全軍撤退，後來還全部被俘虜。
卡特救了歐尼爾，歐尼爾將哈索爾（1X13）推入池中（不知道是真死還是假死？），後來還關掉力場防護罩的電源供應。
另一方面，提歐克回到他的母星召集叛變的tu'lak人，回到這個星球絕地大反攻。
最後，終於擊退高達人一行人也順利會到地球。
這一集不錯看。
3X02：卡特上尉的父親來到地球，跟SG小組講一件事，高達人曾經做過戶口普查，後來發現一支宗族消失了，這個宗族叫做「seth」，經過調查可能在地球上，不過他沒有石棺，所以可能每400年就換一個宿主，總之，經過調查，這個埃及外星人真的在美國國境內。
SG-1小組當然是將他找出來，不過卡特拿到了他父親的武器，意外將seth殺掉了，也算是圓滿結局，另外，他們還得到一大堆高達人的武器，應該可以好好研究了。
3X03：曾經在2X15的外星人Asgard突然將歐尼爾傳到地球軌道的外星人太空船上，這個Asgard叫做Thor索，索告訴歐尼爾說想要要求地球人跟高達人談判，和平協定，阿波菲斯已經死亡，可是如果其他高達人的勢力向地球侵略，那地球絕對檔不住。
後來，他們決定聽索的意見，在地球和三方高達人的勢力做談判，分別是YU、CRONNS、NIRRTI，這三方高達人其實也是心懷鬼胎，彼此看不爽，後來他們才瞭解Asgard為什麼會想居中協調，因為Asgard在別的銀河又有別的敵人，所以必須跟高達人和平共處。
可惜這個合約根本對地球不公平，甚至要地球放棄星際之門，就在爭執不休的時候，CRONNS竟然受重傷了，經過一番追查，確定是NIRRTI搞的鬼，最後，高達人同意不攻打地球，但是萬一那天侵害他們權益這一切都不算數，所以等於是白忙一場。
卡特上尉，這集陞官成為少校。
3X04：SG-1小組到達一個星球，這個星球住著或拘禁者9個高達人，不過不知什麼原因通通都死掉了，不巧丹尼爾感覺被針刺一下，回到地球之後，果然開始感覺到不舒服甚至發瘋。
後來果然發現一個蟲，這時候轉機還是出現，卡特上尉因為曾經有一個高達的寄生蟲死在體內，所以他體內出現一種抗體可以對抗這個蟲，千鈞一刻之際，將所有人解救，順便也救了提歐克。
這一集很明顯點了兩點，一、地球人的文明實在還很落後，二、明明只有丹尼爾正確，卻因為集體暴力大家將丹尼爾關起來並不相信。
3X05：SG- 1與一群叫做ORBAN的外星人友好，他們應該是阿茲提克人的祖先或後代，詭異的是，他們的小孩卻非常聰明，比大人還聰明，經過研究後來才發現，原來他們 還是寶寶的時候就被植入奈米機器人，由奈米機器人代替大腦的神經連結，等到他們成年再將奈米機器人給傳出來當作類似集體智慧，可是相對的這個小孩就變成植 物人，這個文明用這種方式進步。
歐尼爾曾經想解救一個女孩MERRIN，是最後不成功，這個文明就是靠這種方式迅速進步的，小女孩MERRIN還是決定回去，可是回去之後，她再傳開的集體智能讓所有的人民都開始知道玩樂及學習，這一集就在這樣溫馨的狀態下結束了。
3X06：某一天，另一個平行時空的凱特及在1X02的已經死掉的梅傑突然透過量子鏡到這個宇宙。他們不希望再回去了，可是凱特卻出現頭暈現像，似乎表示一個時空不能存在兩個凱特，再換句話說，他們兩個一定要回去。
總之，提歐克、歐尼爾、丹尼爾、跟這這兩個人到他們的時空跟那個時空的阿波菲斯反擊，並且找到那個時空的外星人Asgard，果然Asgard趕到並將阿波菲斯趕走，之後喬治將軍決定將這個量子鏡毀掉。
3X07：SG-1小組到達一個星球被一個自稱Aris boch的賞金獵人抓起來，後來他們談起交換條件，願意協助抓在這個星球上的高達人叫Kel'ta，抓到了就放SG-1回去。
一開始歐尼爾不想配合，可是之後又願意了，沒想到抓到的這個Kel'ta根本不是高達人，他是Tok'ra人，賞金獵人Aris boch其實是被高達人用毒品控制的，後來提歐克想辦法說服Aris boch，放他們回去，沒想到，真的說服成功了......
總之，這一集就在一種很詭異的感覺下結束了。
3X08：這一集爆無聊，SG-1小組達到一個星球，該星球人民應該是中世紀從歐洲被抓到該星球的人，被一個外星人外型的高達人統治，後來SG-1小組殺死了這個高達人，救了這邊的人。
提歐克這集差一點被水淹死，不過體內的高達幼蟲似乎可以吸收水裡的氧氣，所以提歐克竟然不會死。
3X09：SG-1到達一個星球，詭異的是這邊竟然有一群SG團隊和另一群高達人在對戰，更奇怪的是，SG團隊的號次竟然是X，也就是SG-X，歐尼爾等人被擊昏醒來後發現，這裡根本不是任何地球的部隊，這裡是阿波菲斯訓練士兵的場所。
原來阿波菲斯曾經抓住SG-11的成員，逼迫這些成員仿製美國的環境在這邊做訓練，可是阿波菲斯後來集結兵力攻打地球，兩艘太空船都毀掉後聲勢下滑，甚至後來還死掉，這個士兵就很詭異的變成孤兒，每天還繼續操練下去。
歐尼爾說服他說阿波菲斯死掉，並且用立體投影機讓全部的人知道阿波菲斯已經死掉的消息，最後讓全部的人回各自的家，也結束這場永無止境的訓練。
3X10： 丹尼爾的岳父kasuh發求救訊息給SG小組，SG小組到達Abydonians星與高達人展開攻擊，這時候，丹尼爾的太太Sha're竟然出現，可惜她 現在已經是高達人了，就在千鈞一刻之際，提歐克將Sha're給殺了，丹尼爾後來非常生氣，並且決定離開SGC，因為他的目的已經不在了。
後來，當然經過一番轉折，丹尼爾還是決定回歸SG-1。
3X11：SG-1小組到達一個叫做Vorlix的星球，卻發現這個星球的所有人記憶都喪失了，詭異的是，這個星球也沒有小孩、也沒有老人。
後 來經過研究與解秘，他們瞭解到一位年輕的女領導竟然就是2X03那個曾經製造生化武器毀滅掉某個星球的女魔頭Ke'ra，不過她記憶也遺失了，並且改名叫 做Linea，原來Linea回到她的星球之後，就研究改造那個星球，她使用一種叫做Dargol的藥，將所有老人全部年輕化，可是這個要有兩個副作用， 就是記憶會遺失，另外還不導致不孕，換句話說，這個星球就變成這個樣子了。
雖然DGC對她還是不信任，但是還是在監控下讓她研究解藥，最後研究出解藥了，她回到自己的星球。
3X12、3X13： 這兩集一起看，這兩集還蠻無聊了，有一點在為後面鋪梗，話說卡特少校的父親Selmak被高達人Sokar種族抓走了至一個叫做Netu的星球，於是 Tok'ra希望得到SGC的幫忙，於是SG-1就乘坐太空傳到達Netu星，另外他們還需要借重卡特少校，因為她曾經被Tok'ra人 Jolinar(2X02)寄生，偏偏這個Tok'ra人Jolinar又曾經從Netu這個星球逃出來過，雖然Tok'ra人Jolinar已經死亡， 但是殘留的記憶卻可以給他們很多幫助。
總之，SG-1開太空船到這個叫Netu的星球，中間很無聊的過程，唯一值得一提的是阿波菲斯並沒死掉並化名叫做Na'onak，其實在2X18就有提到過，阿波菲斯還是會被覆活然後不斷被虐待，果然阿波菲斯就在這個素有叫做地獄的星球當起某個小官。
總 之，經過一番波折，SG-1總算逃出這個星球，這一集明明可以拍成一集，卻弄成兩集，所以裡面很多很枯燥的內容，可是每次編劇寫到這種無聊的劇情，大概就 知道，後面要鋪陳新的劇情了，事實上阿波菲斯根本沒從這個劇本消失，他還是一直出現，不過真的很慘，最佳苦主就是他啦。
3X14：SG-1一如往常回到地球，卻被喬治將軍要求去體檢，雖然這是標準流程，但是總覺得那邊怪怪的，一直到他們都被注射鎮靜劑，才開始覺得怪怪的。
提歐克因為體內有蟲，所以他最先醒來，他叫醒卡特少校，可惜提歐克又被抓走了，另一方面，卡特少校逃出到外面，到達華盛頓DC去找到Maybourne上校，不過上校卻跟丹尼爾和歐尼爾在一起，他們共同說服她坐飛機回到SGC去接受檢查，看看是不是出現幻覺。
在超音速飛機上歐尼爾上校突然出現詭異現像，後來卡特少校機警搶了一把槍把化身成歐尼爾的外星人給殺了，後來他們發現丹尼爾和機師也是外星人，Maybourne上校不是，於是Maybourne上校回去召集士兵進行大反擊。
另 一方面，真正的歐尼爾這時醒過來，課能因為分身外星人被殺了，總之，最後他們進行大反擊，卡特少校製造一中超音波的機器，可以讓外星人顯形，外星人首領來 不及回去就自爆了，不過一些地球的知識及技術卻可能已經外洩了，經過調查，有一天SG-6回來就已經全部是外星人滲透了，以後回到地球要增加這一項超音波 檢查流程。
這個外星人後面應該還有故事可以演，期待續集出現。
3X15： 有一天一個地球人的好朋友Narim，（1X16的陀藍星人Tollan Narim，SGC曾經幫助他們跟NOX星人聯絡上，讓這些陀藍星人回到自己的星球，奧瑪還收養一隻貓Schroedinger並且對卡特愛戀，他們科技 很高，甚至可以穿牆，不過他們就是不願傳授知識給地球人就是了，另外Nox部分，在1X17，他們自稱羅神或叫做Nox，科技超進步，曾經和Asgard 和雷神和發明星際之門的古人，四個民族組成聯盟，強盛了很長的一段時間）突然拜訪地球，希望SG-1參加一個叫做Triad的活動，簡單說這個活動就是審 判。
原來，Skaara（在電影版中跟丹尼爾是好朋友的小男生，後來被阿波菲斯抓走了變成他的兒子，體內的高達蟲就一直控制他到現在）疑 似攻擊陀藍星被打下來，於是他們參加一場審判，站在地球人的立場辯論高達蟲該不該仍存在這個人體內（見鬼了，這個還需討論嗎？不過對於高達人來說他們認為 人類比較低等就如同牲畜一樣，寄生在這個物種身上是應該的），總之，他們展開法庭攻防。
後來他們成功打贏這場官司，Skaara和體內的高達蟲（叫做Klorel）被判要分離，並這這支蟲送回高達人的星球。
過程中，高達人想暗中突襲陀藍星，可惜被提歐克順利化解了，當然Nox人Lya也幫助他們一點忙，強化這這些的友誼。
3X16：SG-1到達一個星球P4X-884，詭異的是，他們剛剛去就回來，可是過程卻花了15個小時，其中過程完全不記得，甚至出現幻覺，他們共同出現一個人叫做Urgo的人，這個Urgo根本是幻覺，原來又是外星人搞的鬼，他們用Urgo來瞭解外星人的生活行事等等資料。
後來他們當然回去找到主人，主人說Urgo純粹是個意外，他就讓這個Urgo回去了，再也沒有煩人的Urgo出現了，這類的外星人就顯的很不友善，不過還好沒攻擊性。
3X17：SG-1四人到達一個星球，這個星球的文明大概等同於歐洲中古時代農莊文明的層次，沒想到竟然經歷了每150年才會發生的流星轟炸地面的歷史，而這一集的苦主就是歐尼爾上校，星際之門在流星雨之後被泥土埋掉，地球雖可以撥號，但是外層全都是泥土，並且星際之門平躺。
另一方面，歐尼爾跟一個叫做Laira的女生發生感情，歐尼爾顯的掙扎，似乎就要定居下來了，直到有一天提歐克努力鑽洞，並用對講機跟歐尼爾聯絡上了，故事到這邊就知道，最後劇情和平收場。
越到後面幾集就越期待這一季會怎麼收尾。
3X18：SG- 1與陀藍星人談判得不到結果，因為歐尼爾想得到陀藍星的武器，歐尼爾上校在氣憤之下拆毀了一個裝置並帶回地球，後來甚至對陀藍星人的首領Eminence 發脾氣，喬治將軍於是將歐尼爾解職，之後，Maybourne上校果然找上歐尼爾，希望歐尼爾參加另一個地下的SG團隊，這個地下的組織違反道德，瘋狂搜 刮外星人的武器技術，歐尼爾並協助他們運送武器回地球。
後來真相大白，原來歐尼爾根本在演戲，為了抓出這些非法的叛徒所演的戲，地下的SG團隊整個被抓，也讓陀藍星人和Asgard再度回覆好印象。
Asgard人好像真的很喜歡歐尼爾，連歐尼爾自己都說，他算是他們心中的地球代表。
3X19：SG- 1接通一個叫做p2x-416的星球，之前都播不通，原來這個星球上的考古學家Nyan也才將星際之門挖出來，這個星球科技比地球更加進步一些，擁有雷射 槍、飛行器、通電的籠子甚至直接回覆眼神經的醫療器材，可惜這個星球在內戰，一個軍人率領士兵將小組全部俘虜了，他相信星際之門是敵國派來的武器。
提 歐克逃出來並沒被抓到，他與Nyan共同拯救了SG-1，並且解開一個迷團，因為他們的神叫做Nefertum，事實上，這個Nefertum根本就是高 達人，他奴役一堆人類帶到這個星球，可能跟地球經過類似的遭遇，當地人叛變並將星際之門埋起來，所以才會出現後續的文明。
後來Nyan留在地球，幫助丹尼爾研究古代史。
3X20： 提歐克的師傅布萊格塔克帶著快死掉的徒弟莫克來到地球，因為他們的母星tu'lak楚啦克遭受阿波菲斯率領的索卡爾軍隊攻擊，傷亡慘重，原來阿波菲斯想要 找尋他跟他的助手阿莫奈特（寄生於波麗身上）所生的小孩哈賽西斯，這個哈賽西斯被藏在一個叫做凱波的地方，經過找尋珠於找到凱波位在一個叫做 Loc'nako的星球上。
高達人因為不知名的原因懼怕個星球，所以雖然知道這個星球但是一直都沒有開發，但是果然準備進攻了，一來就是2000人的軍隊，事實上，高達人懼怕這個星球因為這個星球有一個更高層次的外星人在保護，最後當然將這些高達軍隊打敗。
3X21：SG-1在某個星球尚竟然發現了一個巨大的金字塔，裡面竟然也放跟瑪雅文明一樣的水晶骷顱頭，丹尼爾看一看，沒想到竟然變成靈魂，SG-1全部逃回去地球，後來，他們發現丹尼爾的祖父曾經研究過地球的水晶骷顱頭，於是他們去找了丹尼爾的祖父。
丹尼爾的祖父根本就住進精神病院，因為他研究關於水晶骷顱頭的知識根本沒人相信，後來，丹尼爾竟然可以跟他祖父溝通，於是透過他祖父告訴SG-1要逆轉這一切就要物歸原主，後來，他們遇到巨人族的外星人，丹尼爾的爺爺甚至留在那邊不回來了，SG-1就回地球了。
3X22： 某天歐尼爾上校正要休假時被ASGARD的索傳上太空船，原來ASGARD面臨滅亡危機，ASGARD雖然文明及科技這麼進步，但是還是有敵人，這個敵人 竟然是機械蜘蛛，原來，這個機械蜘蛛是ASGARD在某次探勘任務時到一個星系，卻發現這個星系整個文明都滅亡只剩機械蜘蛛，他們帶回一支去研究，沒想到 卻釀成大禍，因為機械蜘蛛吃任何金屬或能源，而且不斷進化，即便開槍打碎，他們都會再組合起來。
歐尼爾於是肩負起幫助索的任務，之後，卡特少校、提歐克一併傳到太空船上去幫助ASGAR，他們決定引爆太空船，可是又不能讓機械蜘蛛掉到地球，另一方面傳輸裝置、維生系統等不斷開始毀壞。
後來，他們在太空船上裝炸彈，快墜落到地球時引爆炸彈，並且將星際之門也傳到太空船上，從星際之門逃走，還好地球還有一個星際之門，所以他們再回來，故事還沒完，事實上，還是有一隻機械蜘蛛活下來，故事要接到第四季。
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